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随着互联网的发展和教育水平的提高，学术诚信的问题日益受到关注。在大学阶段，毕业论文作为一项重要的学术成果，查重成为了必要的环节之一。

学校通常会提供专门的查重系统，通过该系统检测论文的原创性。这种方式的优点是操作简便，便于学生使用，同时也利于学校监督学术诚信。然而，学校查重系统的局限在于其算法和数据库的限制。有些系统可能只能检测到公开发表的论文或网络上的大段抄袭，而无法发现一些未公开发表的资料或个别修改后的抄袭。

同时，学生可以将论文提交给一些专门的查重机构进行检测。这些机构通常拥有更全面的数据库和更先进的查重算法，能够更全面地查重。然而，这种方式需要付费，对于一些学生来说可能会有一定的经济压力。

除了依赖查重软件之外，人为审核也是不可或缺的一环。学校通常会组织一些教师或专家进行论文审核，对论文进行人工比对。这种方式能够发现一些无法通过软件检测的细微抄袭或篡改。

毕业论文的查重方式主要包括学校查重、第三方自查和人为审核。学校查重系统操作简便，但存在算法和数据库的限制；第三方自查全面性强，但需要付费；而人为审核能够发现一些软件无法检测的问题。此外，也可以采取不依赖查重软件的方法来降低抄袭风险。只有通过多种方式的综合使用，才能更好地确保毕业论文的原创性和学术诚信。