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随着科技的不断发展和信息的快速传播，学术界对于保证学术诚信和避免抄袭行为的重视也日益增加。而论文查重作为一种常见的手段，已经成为评估学术作品原创性的重要工具。然而，在进行论文查重的过程中，是否需要修改目录格式仍存在一定的争议。

目录是论文的重要组成部分，它展示了论文的结构和内容安排，有助于读者快速定位所需信息。然而，由于论文查重系统通常会忽略目录中的文本内容，只关注正文部分，一些人认为在进行论文查重之前修改目录格式是没有必要的，并且可能浪费时间和精力。

另一方面，也有人认为修改目录格式可以提高查重系统的准确性。因为在一些情况下，抄袭者可能会通过在目录中插入额外的空行、关键词或其他文本，来尝试规避查重系统的检测。因此，通过对目录格式进行修改，可以清除这些干扰项，使得系统能够更准确地检测文本的重复和相似度。

鉴于目前尚无一致的共识，是否修改目录格式还是需要根据具体情况来决定。如果查重系统对目录内容并不敏感，或者论文中的目录并未被篡改，那么修改目录格式可能是不必要的。然而，如果查重系统对目录内容敏感，并且存在抄袭者可能在目录中藏匿的情况，那么修改目录格式可能是有必要的。

综上所述，论文查重时是否需要修改目录格式仍然是一个有待探讨和进一步研究的问题。在进行论文查重时，需要综合考虑论文的具体情况和查重系统的特点来进行决策，并保证学术诚信的同时，提高查重系统的准确性。